Лаборатория математических методов анализа сверхбольших данных

Исследовательские направления и задачи:

  • Разработка и исследование новых эффективных методов обнаружения скрытых закономерностей в сверхбольших данных
  • Развитие инструментариев топологического анализа данных
  • Методы метрического анализа сверхбольших данных субквадратичными по сложности методами
  • Подходы к кросс-валидации на основании теории классификации значений признаков
  • Разработка шкалируемых алгоритмов параллельных вычислений для метрического анализа сверхбольших наборов разнородных признаковых описаний
  • Разработка и исследование эффективных алгоритмов анализа больших объемов биомедицинских данных
  • Вне-биологические приложения разрабатываемых методов (решение задач материаловедения, прогнозирование свойств высокотемпературных сверхпроводников (ВТСП), прогнозирование свойств различных материалов и т. п.)

↓ 

Наши публикации:

И. Ю. Торшин, О. А. Лиманова, О. А. Громова, Н. К. Тетруашвили, В. М. Коденцова, С. И. Малявская, Т. Р. Гришина, А. Г. Калачева, Е. В. Мозговая, И. Н. Захарова, А. Н. Галустян, В. А. Семенов, А. Н. Громов, А. В. Лебедев, Н. В. Керимкулова, Н. П. Лапочкина, Н. В. Никифорова, О. А. Назаренко, Т.Е. Богачева, Л. Э. Федотова, И. В. Гоголева, Н. Ю. Жидоморов, Д. Е. Фролова, А. Н. Рубашкина, В. Н. Серов. Метрический анализ данных по взаимосвязям между показателями микронутриентной обеспеченности и состоянием здоровья женщин 18–45 лет. Медицинский алфавит № 21/2018, том № 2, c. 10-20.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Захарова И.Н., Малявская С.И., Егорова Е.Ю., Лиманова О.А., Семенов В.А. Недостаточность витамина В и коморбидные состояния у детей 7-16 лет: интеллектуальный анализ данных. Качественная клиническая практика №4, 2017 с.58-67.

О.А.Громова, И.Ю.Торшин, А.Н.Громов; Т.Р.Гришина, А.Г.Калачева, Н.В.Керимкулова, О.А.Лиманова, С.И.Малявская, Н.К.Тетруашвили, В.Н.Серов, В.М.Коденцова, Е.В.Мозговая; О.Н.Грачева. Интеллектуальный анализ данных по течению и исходу беременности: роли различных витаминно-минеральных комплексов. Медицинский алфавит. Современная гинекология. 2018;6(1):10-23

Торшин ИЮ, Громова ОА, Лила АМ и др. Результаты постгеномного анализа молекулы глюкозамина сульфата указывают на перспективы лечения коморбидных заболеваний. Современная ревматология. 2018;12(4):129–136.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Кобалава Ж.Д., Сорокина М.А., Виллевальде С.В., Галочкин С.А., Гоголева И.В., Грачева О.Н., Гришина Т.Р., Громов А.Н., Егорова Е.Ю., Калачева А.Г., Малявская С.И., Мерай И.А., Семенов В.А. Дефицит магния и гиперкоагуляционные состояния: метрический анализ данных выборки пациентов 18–50 лет лечебно-профилактических учреждений России. Кардиология. 2018;58(4).стр.20-32

I. Zakharova, L. Klimov, S. Maltsev, S. Malyavskaya, O. Gromova, V. Kuryaninova, S. Dolbnya, A. Yagupova, Anna Kasyanova, Ekaterina Solovyeva and Ekaterina Koroleva. Management of Vitamin D Insufficiency in Young Children in the Russian Federation. Journal of US-China Medical Science 14 (2017) 192-202 doi: 10.17265/1548-6648/2017.05.002

И.Ю.Торшин, О.А.Громова, Е.А.Ковражкина, О.Д.Разинская, О.А.Прокопович, Л.В.Стаховская. Интеллектуальный анализ данных о взаимосвязях между микроэлементным составом крови и состоянием пациентов с боковым амиотрофическим склерозом указал на сниженные уровни лития и селена. Consilium Medicum. Неврология и ревматология. 2017;9:88-96

Торшин И.Ю., Громова О.А., Субботин А.В., Этенко Д.А., Пепеляев Е.Г., Семенов В.А., Белоусова Н.П. Способ неинвазивной оценки среднего уровня нейротрофического фактора мозга (bdnf) в плазме крови на основе показателей микроэлементного анализа волос. Патент РФ 2671636, 2018.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Тапильская Н.И. Фармакоинформационный анализ молекул препарата Климактоплан. Фармакокинетика и фармакодинамика. 2018;1:ХХ–ХХ. DOI: 10.24411/2587-7836-2018-100ХХ

Torshin I.Y., Rudakov K.V. Combinatorial analysis of the solvability properties of the problems of recognition and completeness of algorithmic models. part 1: factorization approach. Pattern Recognition and Image Analysis (Advances in Mathematical Theory and Applications). 2017. Т. 27. № 1. С. 16-28. doi 10.1134/S1054661817010151

Torshin I.Y., Rudakov K.V. Combinatorial analysis of the solvability properties of the problems of recognition and completeness of algorithmic models. Part 2: Metric approach within the framework of the theory of classification of feature values. Pattern Recognition and Image Analysis, 2017. Т. 27. № 2. С. 184-199. doi 10.1134/S1054661817020110

Torshin I.Yu., Rudakov K.V. On metric spaces arising during formalization of recognition and classification problems. part 1: properties of compactness. Pattern Recognition and Image Analysis (Advances in Mathematical Theory and Applications). 2016. Т. 26. № 2. С. 274.

Torshin I.Yu., Rudakov K.V. On metric spaces arising during formalization of problems of recognition and classification. part 2: density properties. Pattern Recognition and Image Analysis (Advances in Mathematical Theory and Applications). 2016. Т. 26. № 3. С. 483-496.

Tatarchuk A., Torshin I., Mottl V., Sulimova V., Windridge D. Supervised selective kernel fusion for membrane protein prediction. Lecture Notes in Computer Science. 2014. Т. 8626 LNBI. С. 98-109.

Yu. Torshin, K. V. Rudakov. On the Theoretical Basis of Metric Analysis of Poorly Formalized Problems of Recognition and Classification. Pattern Recognition and Image Analysis, 2015, Vol. 25, No. 4, pp. 577–587.

Громова О.А., Егорова Е.Ю., Торшин И.Ю., Юдина Н.В. Верифицированная комплексная шкала «калий: плазма, эритроциты, моча» (КПЭМ) для неинвазивной оценки состояния гомеостаза калия у пациентов. Терапия. 2017. № 6. С. 18-28.

Егорова Е.Ю., Быков А.Т., Громова О.А., Торшин И.Ю., Слышалова Н.Н., Хватова Н.В. Здоровьесберегающие технологии поддержки микронутриентами функции зрения у студентов с миопией. Фармакокинетика и фармакодинамика. 2016; 4:55-62.

О. Прокопович, И. Торшин, О. Громова, Е. Гусев. Коморбидность дисциркуляторной энцефалопатии с диабетической полинейропатией, лобной атаксией и уровнями микроэлементов в крови.Врач, №3, 2016. С.6-11.

О.А. Лиманова, Громова О.А., И.Ю. Торшин, И.Н. Захарова, А.Г. Калачёва, Н.В. Белоусова, Е.Ю. Егорова, Е.А. Евсеева, А.Н. Галустян, Т.Р. Гpишина, А.Ю. Волков, И.М. Косенко, С.И. Малявская, А.В. Pахтеенко, К.В. Pудаков, В.А. Семёнов, О.В. Семёнова, Л.Э. Федотова, С.Н. Щеpбо, Н.В. Юдина, И.К. Томилова.Сезонные вариации обеспеченности витаминами и микроэлементами в когорте детей 3-14 лет.Медицинский совет. 2016. №7. С.20-27

Прокопович О.А., Волков А.Ю., Торшин И.Ю., Громова О.А., Гусев Е.И., Никонов А.А., Смарыгин С.Н.Микроэлементный состав крови пациентов с дисциркуляторной энцефалопатией.Медицинский алфавит. 2016. Том1, №3. С.42-48

О. Прокопович, И. Торшин, О. Громова, Е. Гусев. Взаимосвязи микроэлементного состава крови у пациентов с дисциркуляторной энцефалопатией. Врач №10, 2015. С.2-7

И.Ю. Торшин, О.А. Громова, И.В. Гоголева, О.А. Лиманова, Е.Ю. Егорова, И.С. Сардарян, Н.В. Юдина, Т.Р. Гришина, Л.Э. Федотова, А.Н. Галустян, С.И. Малявская, А.Ю. Волков, А.Г. Калачева, К.В. Рудаков, И.М. Косенко, В.А. Семенов.    Роль обеспеченности микронутриентами в поддержании здоровья детей и подростков: анализ крупномасштабной выборки пациентов посредством интеллектуального анализа данных. Педиатрия Том 94, №6, 2015. С.68-78.

И.Ю. Торшин, О.А. Громова, О.А. Лиманова, И.С. Сардарян, С.И. Малявская, Т.Р. Гришина, А.Н. Галустян, А.Ю. Волков, А.Г. Калачева, А.Н. Громов, К.В. Рудаков. Обеспеченность витамином d детей и подростков 7–14 лет и взаимосвязь дефицита витамина d с нарушениями здоровья детей: анализ крупномасштабной выборки пациентов посредством интеллектуального анализа данных. Педиатрия, 2015, 94(2), с. 175-184.

Е.Ю. Егорова, И.Ю. Торшин, О.А. Громова, А.И. Мартынов. Применение кардиоинтервалографии для скрининговой диагностики и оценки эффективности коррекции дефицита магния и коморбидных ему состояний. Терапевтический архив 8, 2015, с. 16-28.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Л.Э. Федотова, Калачева А.Г. Метаболомный компендиум по оротату магния. Эффективная фармакотерапия.  Кардиология и ангиология №3, 2015. С.14-26

I. Yu. Torshin and K. V. Rudakov. On the Application of the Combinatorial Theory of Solvability to the Analysis of Chemographs. Part 1: Fundamentals of Modern Chemical Bonding Theory and the Concept of the Chemograph. Pattern Recognition and Image Analysis, 2014, Vol. 24, No. 1, pp. 11–23.

Yu. Torshin and K. V. Rudakov. On the Application of the Combinatorial Theory of Solvability to the Analysis of Chemographs: Part 2. Local Completeness of Invariants of Chemographs in View of the Combinatorial Theory of Solvability. Pattern Recognition and Image Analysis, 2014, Vol. 24, No. 2, pp. 196–208.

О.А.Лиманова, И.Ю.Торшин, И.С.Сардарян, А.Г.Калачева,   О.А.Громова, Т.Р. Гришина и др. (всего 15 чел.). Обеспеченность микронутриентами и женское здоровье: интеллектуальный анализ клинико-эпидемиологических данных. Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии, 2014, т. 13, №2, с. 5–15

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, О.А. Лиманова, И.В. Гоголева, А.Г. Калачева, Рудаков К.В., (всего12 чел.). Анализ взаимосвязи между обеспеченностью магнием и риском соматических заболеваний у россиянок 18-45 лет методами интеллектуального анализа данных. Эффективная фармакотерапия, №23, 2014. с.10-23

Torshin I. Yu. Optimal Dictionaries of the Final Information on the Basis of the Solvability Criterion and Their Applications in Bioinformatics. Pattern Recognition and Image Analysis, 2013, Vol. 23, No. 2, pp. 319–327. © Pleiades Publishing. DOI: 10.1134/S1054661813020156. ISSN 1054-6618.

Громова О.А., Калачева А.Г., Торшин И.Ю., Рудаков К.В., Грустливая У.Е., Юдина Н.В., Егорова Е.Ю., Лиманова О.А., Федотова Л.Э., Грачева О.Н., Никифорова Н.В., Сатарина Т.Е., Гоголева И.В., Гришина Т.Р., Курамшина Д.Б., Новикова Л.Б., Лисицына Е.Ю., Керимкулова Н.В., Владимирова И.С., Чекмарева М.Н. с соавт. Недостаточность магния – достоверный фактор риска коморбидных состояний: результаты крупномасштабного скрининга магниевого статуса в регионах России. Фарматека. 2013. № 6 (259). С. 116-129.

Зангиева З.К., Е.И. Гусев, О.А. Громова, И.Ю. Торшин, А.А. Никонов, А.П. Ракша, А.И. Волков. Сравнительный анализ микроэлементных профилей 10 отделов головного мозга при ишемическом инсульте и без ишемических повреждений. Земский врач. – 2013.- №4 (30). – С.11-21.

Зангиева З.К., Торшин И.Ю., Громова О.А., Никонов А.А. Содержание микроэлементов в нервной ткани и ишемический инсульт. Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 2013. Т. 113. № 3-2. С. 30-36.

Керимкулова Н.В., Никифорова Н.В., Владимирова И.С., Торшин И.Ю., Громова О.А. Влияние недифференцированной дисплазии соединительной ткани на исходы беременности и родов. комплексное обследование беременных с дисплазией соединительной ткани с использованием методов интеллектуального анализа данных. Земский врач. 2013. № 2 (19). С. 34-38.

Н.В. Керимкулова, В.Н. Серов, О.А. Громова, И.Ю. Торшин, Н.П. Никифорова,  Л.П. Перетятко, Р.А. Кузнецов. Влияние недифференцированной дисплазии соединительной ткани на исходы беременности и родов: клинические аспекты и морфологические и иммуногистохимические особенности плаценты. Земский врач. – 2013.- №2 (19). – С.5-9.

Рудаков К.В., Торшин И.Ю. Анализ информативности мотивов на основе критерия разрешимости в задаче распознавания вторичной структуры белка. Информатика и ее применения. 2012. Т. 6. № 1. С. 79-90.

Патенты, полученные в результате применения разрабатываемых методов анализа данных:

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU), Никонов Алексей Алексеевич (RU), Гоголева Ирина Викторовна (RU). Литийсодержащее средство для профилактики и лечения цереброваскулярных заболеваний и способ применения данного средства // RUS 2367427.  2008

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU). Способ профилактики и лечения нейродегенеративной патологии и сосудистой деменции // RUS 2587617. 2014

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU). Средство для профилактики и лечения нейродегенеративной патологии и сосудистой деменции (варианты) // RUS 2582962.  2014

Керимкулова Надежда Вячеславовна (RU), Никифорова Надежда Владимировна (RU), Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU). Способ прогнозирования наличия недифференцированной дисплазии соединительной ткани у беременных // RUS 2539996, 2014

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU),  Егорова Евгения Юрьевна (RU),  Егоров Сергей Юрьевич (RU). Способ диагностики снижения уровня калия в эритроцитах // RUS 2593982 2016

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU),  Егорова Евгения Юрьевна (RU),  Егоров Сергей Юрьевич (RU). Способ диагностики синдрома вегетативной дистонии по гипотоническому типу // RUS 2587036, 2016

Громова Ольга Алексеевна (RU), Торшин Иван Юрьевич (RU), Семенов Владимир Александрович (RU), Этенко Данил Андреевич (RU). Неинвазивный способ  оценки усредненного уровня  нейротрофического фактора мозга (bdnf) в плазме крови на основе показателей микроэлементного анализа волос// RUS — 2017

 

 

Конференции:

Торшин И.Ю., Рудаков К.В. Об основах метрического анализа плохо формализованных задач распознавания и классификации Математические методы распознавания образов (ММРО-17). г. Светлогорск, Калининградская область, 19-25 сентября 2015.

Громова О.А. Нейротрофическая терапия: новые возможности. Витамин D – смена парадигмы. X Научно-практический конгресс с международным участием «Рациональная фармакотерапия 2015», 8-10 октября 2015г.

И. Ю. Торшин, К.В.Рудаков. О комбинаторном анализе локальной полноты размеченных графов. ИОИ, 4-11 октября  2014, о. Крит, Греция. machinelearning.ru/wiki/images/d/d1/Torshin2014iip.pdf

Вальков А.С., Воронцов К.В., Инякин А.С., Рейер И.А. Кожанов Е.М., Хусаинов Ф.И. Ботов П.В., Ивахненко А.А. Торшин И.Ю. Проект базовой расчетной модели для прогнозирования грузовых перевозок, включающей сезонности, прогнозы коэффициентов съёма и описания классов поведения заказчиков. Труды и пленарные доклады участников конференции УКИ’12 / Научное издание. Электрон. текстовые дан. – М.:ИПУ РАН, 2012 – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM) – ISBN 978-5-91450-100-3 – С. 56-69. Аннотация: см.  http://cmm.ipu.ru/

Карацуба Е.А., Вальков А. С., Громов А. Н., Рейер И.А., Толстихин И.О., Василейский А.С., Карелов А.И., Ботов П. В., Рудаков К. В., Торшин И.Ю. Построение проблемно-ориентированных метрик для обработки радиолокационных данных в интересах мониторинга потенциально-опасных воздействий на объекты железнодорожной инфраструктур. Труды и пленарные доклады участников конференции УКИ’12 / Научное издание. Электрон. текстовые дан. – М.:ИПУ РАН, 2012 – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM) – ISBN 978-5-91450-100-3 – С. 137-142. Аннотация: см.  http://cmm.ipu.ru/

Пшеничников С.Б., Гришко М.Е. Инякин А.С., Рейер И.А. Рудаков К.В., Стрижов В.В., Торшин И.Ю. Филипенков Н.В. О некоторых возможностях управления расходами РЖД как потребителя электрической энергии. Труды и пленарные доклады участников конференции УКИ’12 / Научное издание. Электрон. текстовые дан. – М.:ИПУ РАН, 2012 – 1 электрон. опт. диск (CD-ROM) – ISBN 978-5-91450-100-3 – С. 860-867. Аннотация: см. http://cmm.ipu.ru/

Razin N, Sungurov D, Mottl V, Torshin I, Sulimova V, Seredin O, Windridge D. Application of the Multi-modal Relevance Vector Machine to the Problem of Protein Secondary Structure Prediction. In: S. Tetsuo et al. (Eds.): PRIB 2012, Springer-Verlag, LNBI 7632, pp. 153–165, 2012.

Разин Н. А., Сунгуров Д. С., Торшин И. Ю., Сулимова В. В., Середин О. С. Применение многомодального обобщения метода релевантных векторов в задаче распознавания вторичной структуры белка. “Интеллектуализация обработки данных”, г. Будва, Черногория, 16-22 сентября 2012 года, c. 585-588

Торшин И. Ю. Оптимальные словари финальных информаций для плохо формализованных задач. “Интеллектуализация обработки данных”, г. Будва, Черногория, 16-22 сентября 2012 года, с. 589-592