Лаборатория системной биологии и биоинформатики

Исследовательские направления и задачи:

  • Разработка методов функциональной аннотации протеома и генома
  • Разработка методов системно-биологического анализа ионов и малых молекул (в т.ч. микронутриентных кофакторов)
  • Анализ молекулярно-клеточных механизмов действия фармакологических средств
  • Распознавание/прогнозирование пространственных структур белков на основе аминокислотных последовательностей
  • Прогнозирование функциональных классов белков
  • Анализ и прогнозирование функциональных эффектов генетических полиморфизмов (SNP и др.)
  • Разработка алгоритмов для поиска и классификации научной литературы
  • Системно-биологический анализ результатов хемоинформационного моделирования
  • Преподавательская работа со студентами ведущих ВУЗов России (МФТИ, МГУ)
  • Разработка перспективных системно-биологических подходов в спортивной медицине

 

Наши публикации:

Громова О.А., Торшин И.Ю., Максимов В.А. Особенность молекулярно-биологических механизмов антацида Антарейт: множественность лечебных эффектов. Consilium Medicum. 2018; 20 (8): 80-84. DOI: 10.26442/2075-1753_2018.8.80-84

Lila AM, Gromova OA, Torshin IY, Montell E (2018) Molecular Effects of Chondroitin Sulfate in Osteoarthritis and Herniated Discs. J Rheumatol Arthritic Dis 3(2): 1-11.

И.Ю. Тоpшин, А.В. Батяновcкий, Л.А. Уpошлев, Н.Г. Еcипова, В.Г. Туманян. Неканоничеcкие и cтpого запpещенные конфоpмации оcтова полипептидныx цепей глобуляpныx белков. Биофизика, 2018, том 63, вып. 2, c. 225–231 (I.Yu. Torshin, A.V. Batyanovskii, L.A. Uroshlev, N.G. Esipova, and V.G. Tumanyan. Non-canonical and Strongly Disallowed Conformations of the Backbone of Globular Proteins Polypeptide Chain. Biophysics, 2018, 63(2):225–231.)

Torshin I.Y., Uroshlev L.A., Esipova N.G., Tumanyan V.G. Descriptive statistics of disallowed regions and various protein secondary structures in the context of studying twisted β-hairpins. Biophysics. 2016. Т. 61. № 1. С. 6-12.

Patrusheva I., Perelygina L., Torshin I., LeCher J., Hilliard J. B virus (macacine herpesvirus 1) divergence: variations in glycoprotein d from clinical and laboratory isolates diversify virus entry strategies. Journal of Virology. 2016. Т. 90. № 20. С. 9420-9432.

Uroshlev L.A., Torshin I.Y., Esipova N.G., Tumanyan V.G., Batyanovskii A.V. Disallowed conformations of a polypeptide chain as exemplified by the β-turn of the β-hairpin in the α-spectrin sh3 domain. Biophysics. 2015. Т. 60. № 1.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Тетруашвили Н.К., Рейер И.А. Синергизм между фолатами и докозагексаеновой кислотой в рамках раздельного приема микронутриентов во время беременности. Акушерство и гинекология. 2018; 7:12-18. dx.doi.org/10.18565/aig.2018.7.

О.А.Громова, И.Ю.Торшин, Н.К.Тетруашвили, О.А.Лиманова. О новых тенденциях в нутрициальной поддержке беременности. Акушерство и Гинекология, №1, 2018, стр.21-28.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Лила А.М., Громов А.Н. Молекулярные механизмы глюкозамина сульфата при лечении дегенеративно-дистрофических заболеваний суставов и позвоночника: результаты протеомного анализа. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2018;10(2):38–44, Gromova OA, Torshin IYu, Lila AM, Gromov AN. Molecular mechanisms of action of glucosamine sulfate in the treatment of degenerative-dystrophic diseases of the joints and spine: results of proteomic analysis. Nevrologiya, neiropsikhiatriya, psikhosomatika, Neurology, neuropsychiatry, psychosomatics. 2018;10(2):38–44. DOI: 10.14412/2074-2711-2018-2-38-44

Торшин И.Ю., Громова О.А., Калачёва А.Г. , Тетруашвили Н.К., Демидов В.И. Мио-инозитол: микронутриент для «тонкой настройки» женской репродуктивной сферы. РМЖ. Мать и дитя. 2018;1(Т.1, №1):1–7.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Калачёва А.Г., Тетруашвили Н.К. Роли мио-инозитола в поддержании репродуктивного здоровья женщины. Повышение эффективности технологий экстракорпорального оплодотворения. РМЖ. Мать и дитя. 2018, No 2. С. 1–8.

О. А. Громова, М. А. Сорокин, А. В. Рахтеенко, К. В. Рудаков. Противовозрастная саплементация системой фамвиталь: влияние на процессы старения и здоровье (клинико-фармакологическое досье, данные доказательной медицины). Медицинский совет, №13, 2018, c. 142-154. doi: 10.21518/2079-701X-2018-13-142-154.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Гилельс А.В., Гришина Т.Р., Томилова И.К. Метаболиты витамина D: роль в диагностике и терапии витамин-D-зависимых патологий.  Фармакокинетика и фармакодинамика. 2016; 4:9-18.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Прокопович О.А.  Синергидные нейропротекторные эффекты тиамина, пиридоксина и цианокобаламина в рамках протеома человека.  Consilium Medicum. Неврология и Ревматология (Прил.). 2016; 2: 76–84.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Тапильская Н.И. Протеомный анализ магний-зависимых белков в системе «мать–плод–ребёнок».  Фармакокинетика и фармакодинамика. 2016; 4:54-66.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Калачева А.Г., Семенов В.А., Рудаков К.В. МексиВ6 как результат фортификации этилметилгидроксипиридина сукцината магнием и пиридоксином: протеомные эффекты. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2016;8(4):38–44.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Моисеев В.С., Сорокина М.А.  О фармакологических взаимодействиях магния с антибиотиками и дефиците магния, возникающем в результате антибиотикотерапии.  Терапия. 2017;1(11):135–143

Громова О.А., Торшин И.Ю.,  Калачева А.Г., Гришина Т.Р. и др.  Тройственный синергизм этилметилгидроксипиридина сукцината, магния и витамина В6: молекулярные механизмы. Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2017;9(1):38-44

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, Н.И. Тапильская Протеомный анализ магний-зависимых белков в системе «мать – плод – ребенок». Медицинский совет. 2017; 1: 8-18

Назаренко О.А., Громова О.А., Гришина Т.Р., Торшин И.Ю.,Демидов В.И., Томилова И.К., Алексахина Е.Л., Гоголева И.В. Коррекция Лаеннеком хронической перегрузки железом печени, почек и головного мозга. Фармакокинетика и фармакодинамика № 2. 2017 C. 39-44

Громова О.А., Торшин И.Ю., Моисеев В.С., Сорокина М.А., Лиманова О.А. Об использовании цинка и витамина С для профилактики и адъювантной терапии острых респираторных заболеваний.  Терапия. 2017;1(11):36–46

О. А. Громова, И. Ю. Торшин, Н. В. Авдеева  О доказательной медицине применения  витаминно-минеральных комплексов во время беременности: читаем с подстрочником. Медицинский алфавит № 23 / 2017, том № 3. Современная гинекология34-43

Громова О.А., Стаховская Л.В., Торшин И.Ю., Томилова И.К. Прием метформина провоцирует нарушения гомеостаза витамина В12.  Consilium Medicum. 2017; 19 (4).

Торшин ИЮ, Громова ОА, Майорова ЛА, Волков АЮ. О таргетных белках, участвующих в осуществлении нейропротекторных эффектов цитрата лития.  Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2017;9(1):78–83.

О.А.Громова, И.Ю.Торшин, И.К.Томилова, Л.К.Джиджихия, Н.В.Керимкулова Калий, магний и пиридоксин в контексте биологических эффектов эстрогенов.  Гинекология. 2017; 19 (3):60-69

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, И.К. Томилова, А.В. Гилельс Метаболиты витамина D: роль в диагностике  и терапии витамин D-зависимой патологии. Практическая медицина. 2017;5 (106): 4-9

Громова О.А., Торшин И.Ю., Мартынов А.И., Сорокина М.А., Егорова Е.Ю. Систематический анализ применения витаминов в рамках многопрофильного стационара. Терапия. 2017. № 6. С. 89-99.

Patrusheva I., Perelygina L., Torshin I., LeCher J., Hilliard J. B virus (macacine herpesvirus 1) divergence: variations in glycoprotein d from clinical and laboratory isolates diversify virus entry strategies. Journal of Virology. 2016. Т. 90. № 20. С. 9420-9432.

Громова О.А., Т.Р. Гришина, И.Ю. Торшин, Е.Ю. Егорова. О роли магния в спортивной медицине. Кардиология,  2016;56:4. С.87-93

О. А. Громова, И. Ю. Торшин. Цинк как необходимый элемент профилактики врожденных пороков развития плода.Медицинский алфавит 2016, том № 1,  № 7, Современная гинекология. С.22-28

Громова О.А.,А.В. Пронин, Т.Р. Гришина, И.Ю. Торшин, Д.П. Калинский, А.Н. Громов .Развитие мозга и когнитивный потенциал витамина D.Фарматека. Педиатрия, №1 (314), 2016. С.27-35

Громова О.А., Торшин И.Ю., Спиричев В.Б. Полногеномный анализ сайтов связывания рецептора витамина d указывает на широкий спектр потенциальных применений витамина D в терапии.Медицинский совет. 2016. № 1. С. 12-21.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Егорова Е.Ю., Быков А.Т., Гоголева И.В.Коррекция дефицита витамина D – здоровьесохраняющая технология.Медицинский алфавит, 2016. Том2, №16. С.18-25

Громова О.А., Калачева А.Г., Гришина Т.Р., Богачева Т.Е., Демидов В.И.Модуляция эффекта противосудорожных средств микронутриентами в эксперименте.РМЖ, 2016. №13. С.874-878

Громова О.А.,  Торшин И.Ю., Пронин А.В., Волков А.Ю. .Синергидные и нейротрофические эффекты пирацетама и тиотриазолина.Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2016; 8(1):86-89

Громова О.А., Торшин И.Ю., Гришина Т.Р., Томилова И.К. Значение использования препаратов  железа  и его молекулярных синергистов для профилактики и лечения железодефицитной анемии у беременных.Российский вестник акушера-гинеколога. 2015. Т. 15. № 4. С. 85-94.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Пронин А.В., Гоголева И.В., Майорова Л.А.Нейростероидные эффекты витамина D. Роль в педиатрии. Фарматека. 2015. № 11 (304). С. 78-87.

Громова О.А., Егорова Е.Ю., Торшин И.Ю., Громов А.Н., Гоголева И.В.О роли магния в спортивной медицине.РМЖ, 2016. №1. С.1-11.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Егорова Е.Ю., Захарова И.Н., Гилельс А.В.Нужно ли назначать витамин D детям и подросткам для достижения неординарных спортивных результатов?.Фарматека, 2016.-N 6.-С.13-23.

Громова О.А., Торшин И.Ю., Пронин А.В.Когнитивный и нейропластический потенциал витамина D у детей и подростков.Фарматека. 2015. № 6 (304). С. 78-87.

Громова О.А., Пронин А.В.,  Торшин И.Ю., Калачева А.Г., Гришина Т.Р. Нейротрофический и антиоксидантный потенциал нейропептидов и микроэлементов.Неврология, нейропсихиатрия, психосоматика. 2015; 7(4):92-100

Громова О.А., Торшин И.Ю., Назаренко А.Г., Калачева А.Г.Дефицит магния и пиридоксина как фактор риска развития ишемической болезни сердца.Кардиология, 2016,56:9. С.111-118

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, И.Н. Захарова, В.Б. Спиричев, Т.Э. Боровик, Г.В. Яцык. О дозировании витамина D у детей и подростков. Вопросы современной педиатрии, №1, том 14, 2015. С.38-47. (№ 649)

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, О.А. Лиманова, Т.Р. Гришина, А.Н. Громов. Обеспеченность витамином D и метаболические нарушения: систематический анализ фундаментальных и доказательных исследований по проблемам избыточной массы тела и сахарного диабета. Фарматека, № 20, 2014, С.27-38 (№ 2022)

И.Ю. Торшин, О.А. Громова, О.А. Лиманова, С.И. Малявская, Т.Р. Гришина, А.Н. Галустян, А.Ю. Волков, А.Г. Калачева, А.Н. Громов, К.В. Рудаков. Обеспеченность витамином d детей и подростков 7–14 лет и взаимосвязь дефицита витамина d с нарушениями здоровья детей: анализ крупномасштабной выборки пациентов посредством интеллектуального анализа данных. Педиатрия, 2015, 94(2), с. 175-184.

О.А.Громова, И.Ю.Торшин, В.Ф.Учайкин, О.А.Лиманова. Роль витамина D в поддержании противотуберкулезного, антивирусного и общего противоинфекционного иммунитета. Инфекционные болезни, 2014, т. 12, №4, с. 65–74 (№ 1040)

И.Ю.Торшин, О.А.Громова, О.А.Лиманова. Систематический анализ состава и механизмов молекулярного воздействия стандартизированных экстрактов Vitex Agnus-castus. Трудный пациент № 1-2, ТОМ 13, 2015. С.19-28

Громова О.А., Торшин И.Ю., Л.Э. Федотова, Калачева А.Г. Метаболомный компендиум по оротату магния. Эффективная фармакотерапия.  Кардиология и ангиология №3, 2015. С.14-26

Керимкулова Н.В., Громова О.А., Никифорова Н.В., Гришина Т.Р., Гоголева И.В., Торшин И.Ю., Рудаков К.В., Аванесова Т.Н. Фармакоэкономический анализ витаминно-минеральных комплексов и препаратов отдельных микронутриентов для нутритивной поддержки беременности. Журнал «Мать и дитя» в Кузбассе.-2014.-№1(56). С.30-40

Н.В.Керимкулова, Н.В.Никифорова, И.Ю.Торшин, И.В.Гоголева, А.Ю.Волков, О.А.Громова. Беременность и роды у женщин с дисплазией соединительной ткани и железодефицитной анемией. Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии, 2014, т. 13, №5, с. 11–21

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, А. Гилельс, Е. Диброва. Систематический анализ данных экспериментальных и клинических исследований по эффективности и безопасности применения витаминов и микроэлементов для достижения положительного эффекта при эстетической коррекции состояния кожи и ее придатков (часть 2). Эстетическая медицина, Том XIII, №2, 2014. С.3-13

А. Гилельс,  И. Жукова,  И. Торшин, О. Громова,  В. Чертушкин,  А. Труханов,  Е. Щукина,  С. Николаев. Применение активных форм  витамина D3 в программе  комплексного ухода за кожей. Эстетическая медицина, том XIII,  №4, 2014. С.562-569

Громова О.А., Серов В.Н., Керимкулова Н.В., Торшин И.Ю., Лиманова О.А., Никифорова Н.В. Мировой опыт использования пиридоксина: экспериментальная и клиническая база применения в акушерско-гинекологической практике. Гинекология. 2013. № 1. С. 85-93.

Громова О.А., Тетруашвили Н.К., Торшин И.Ю., Лиманова О.А. Фундаментальные исследования, доказательная медицина и перспективы использования активных форм фолатов в акушерстве и гинекологии. Фарматека. 2013. № 3 (256). С. 14-24.

И.Ю. Торшин, О.А. Громова, Г.Т. Сухих. Молекулярные роли  микронутриентов в физиологических механизмах закрытия родничков и профилактика краниостеноза. Гинекология. – 2013.- Том 14- №5. – С.48-54.

О.А. Громова, И.Ю. Торшин, Н.П. Сонина, Н.В. Керимкулова. Сколько нужно назначать Омега-3 ПМЖК беременной? Земский врач. – 2013.- №3 (20). – С.10-17.

О.А. Громова, Н.В. Керимкулова,  И.Ю. Торшин, О.А. Лиманова,  А.Н. Громов. Сравнительное исследование доказательной базы эффективности и безопасности применения пероральной и трансдермальной форм заместительной гормональной терапии эстрогенами у женщин в различные возрастные периоды. Проблемы репродукции. – 2013.- №6. – С.86-96.

О.А. Громова,И.Ю. Торшин, Т.Р. Гришина, А.Н. Громов,О.А. Лиманова. Систематический анализ молекулярно-физиологических эффектов миоинозитола: данные молекулярной биологии, экспериментальной и клинической медицины . Эффективная фармакотерапия.- 2013.- № 28. – С.4-10

К. В. Рудаков, И. Ю. Торшин. ОБ ОТБОРЕ ИНФОРМАТИВНЫХ ЗНАЧЕНИЙ ПРИЗНАКОВ НА БАЗЕ КРИТЕРИЕВ РАЗРЕШИМОСТИ В ЗАДАЧЕ РАСПОЗНАВАНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА. ДОКЛАДЫ АКАДЕМИИ НАУК, 2011, том 441, № 1, с. 24–28.

Конференции:

Громова О.А., Торшин И.Ю. Prospective of gerontological applications of Laennec: fundamental studies & molecular mechanisms (老年医学分野におけるラエンネックの活用に関する今後の見通し:基礎研究と分子的機序). Пленарный доклад, Конгресс противозрастной медицины, Токио, 18-06-2017

Громова О.А. Витамин D: критерии обеспеченности организма и эффективные дозы XVI Всероссийский Конгресс нутрициологов  и диетологов с международным участием, посвящённый 100-летию со дня рождения основателя отечественной нутрициологии  академика А.А. Покровского «Фундаментальные и прикладные аспекты нутрициологии и диетологии.  Качество пищи», г. Москва 2-4 июня 2016г.

Громова О.А. Метаболиты витамина D: лабораторная диагностика и стратегия терапии. Юбилейный XX форум «Национальные дни лабораторной Медицины России – 2016» Общероссийская междисциплинарная Научно-практическая конференция с Международным участием «Консолидация лабораторной медицины и клинической практики: диагностические инновации, лабораторная индустрия», Москва, Спортивный комплекс «Олимпийский» 14 – 16 сентября 2016 г.

Калачева А.Г., Богачева Т.Е., Гришина Т.Р.,  Громова О.А.Экспериментальное потенцирование противосудорожного действия Габапентина магне-пиридоксиновым комплексом.XI международный научный конгресс «Рациональная фармакотерапия», Санкт-Петербург, 2016.   С. 75-77.